Com o advento da lei 3.268 de 30/09/1957, instituida pelo decreto 44.045 de 19/07/58, foram criados os conselhos federal e regionais de medicina.
Em 27 de agosto de 1987, instalou-se o Conselho Regional de Medicina do Estado do Acre, tendo como membros da diretoria provisória os médicos Laélia Contreira Agra de Alcântara, Maria das Graças Ribeiro Moura Leite, Luiz Antonio Oliveira Cachapuz e Marly Genari Tezza. A gestão durou um ano.
Em 25 de setembro de 1987, foi publicado no Diário Oficial do Estado o primeiro regimento interno da instituição.
A sede do conselho funcionou por algum tempo em uma sala alugada. Depois foi adquirida uma residência com 05 compartimentos: uma sala para recepção, uma sala mais ampla destinada a reuniões, outra para a Secretaria Executiva e Registro de Médicos e Empresas, uma sala de contabilidade e tesouraria e um depósito para materiais de uso e consumo, arquivo da Secretaria Executiva e Registro. Havia apenas um computador para o arquivo de todos.
De outubro de 1988 a setembro de 1993, o CRM-AC estava sob a presidência do médico Gerce Câmara.
De outubro de 1993 a setembro de 1998, o presidente era o médico Edilberto Parigot.
De outubro de 1998 a setembro de 2003, quem assumiu a presidência foi o médico Ricardo Froes Camarão.
No ano de 2002, houve a inauguração do prédio que hoje é sede do conselho, com salas amplas e climatizadas, boas instalações, 15 computadores, nove setores executivos e um veículo motorizado.
Ainda em 2002, foram realizados os seguintes procedimentos e criados manuais:
• Reformulação do Regimento Interno do conselho, que passou a ser mais robusto, adaptado às novas condições da instituição;
• Plano de cargos e salários e normativo de pessoal com vigência a partir de janeiro de 2003;
• Manual de procedimentos administrativos para a àrea judicante – manual do conselheiro;
• Manual de acompanhamento de processos éticos disciplinares para os CRMs;
• Em 09 de agosto de 2002, por meio da resolução CFM nº. 1.644/2002, ficou instituído o Manual de Procedimentos Contábeis e Financeiros;
• Em 06 de novembro de 2002, foi aprovado o Manual de Procedimentos Administrativos – inscrição de médicos e registro de empresas médicas.
Em 2003, o médico Ricardo Camarão foi reeleito, desistindo do cargo logo depois. O vice-presidente, o médico José Wilkens Dias Sobrinho, assumiu a vacância, permanecendo no cargo até março de 2006.
Em 1º de abril de 2006, assumiu a presidência a dra. Dilza Teresinha Ambros Ribeiro que permaneceu no cargo até 30 de setembro de 2013.
Em 1º de outubro de 2013, o médico Marcus Vinicius Shoiti Yomura assumiu a presidência do conselho.
Em 1º de abril de 2016, assumiu a presidência o médico Virgilio Batista Prado.
No dia 1º de outubro de 2018, a médica Leuda Dávalos tomou posse como presidente do CRM-AC.